本书的编排，即按照“转识成智”这一问题的思路，将对清华学派的研究分为三编。第一编是关于清华学派的总论。在第二编中，将对清华学派的哲学思想源流及其历史演变加以考察与论列，其中，关于清华学派与实证主义的关系是本编的一个重点。第三编是对20世纪中国的重要哲学学派——现代新儒家的一些代表人物及其思想的研究。之所以收入这些对于现代新儒家的研究，是为了给清华学派提供一种参照系。
如上所述，在20世纪中国哲学史上，对于转识成智问题的关心，其实不限于清华学派。在转识成智问题上，作出了独特思考并且具有思想创获的，除了清华学派之外，还有现代新儒家。但是现代新儒家们对于转识成智问题的思考，是迥异于清华学派的。如果说清华学派对于转识成智问题是思考受惠于康德，那么，现代新儒家对于这一问题的思考却是反康德或者完全非康德式的。因此，以现代新儒家作为对照，不仅可以说明在20世纪中国哲学史上，对于转识成智问题的思考可以有两种类型，而且可以说明这两种类型的出现都同康德哲学有关。